|
SeekGene повышает эффективность на 500% за счет использования MemVerge Memory Machine в облаке
12, май 2022 —
MemVerge ™, пионер программного обеспечения для работы с большой памятью, объявила сегодня о том, что SeekGene, биотехнологическая исследовательская фирма, специализирующаяся на технологии одиночных клеток ( single-cell technology ), значительно сократила время и стоимость обработки данных для анализа отдельных клеток с большим объемом данных задачи с использованием MemVerge Memory Machine, работающей на вычислительных экземплярах AliCloud i4p. В результате SeekGene наблюдает пятикратное увеличение производительности на виртуальную машину (ВМ) в своих аналитических операциях. В частности, производительность загрузки и экспорта данных его конвейера секвенирования одной клетки улучшилась на два порядка, а размер выборки набора данных, используемого в анализе, удвоился. SeekGene — биотехнологическое предприятие, специализирующееся на одноклеточных технологиях, поддерживающих клиническую диагностику и развитие точной медицины. Медицинская биофармацевтическая организация владеет эксклюзивной платформой для микропористых чипов и двойной технологии «вода-в-масле» и проводит независимые исследования и разработки высокопроизводительных одноклеточных продуктов, экспериментов и комплексных услуг для биоинформатического анализа. Платформа одноклеточной библиотеки SeekOne NGS от SeekGene, автоматизированная онлайн-платформа для анализа данных SeekGene Online, а также запатентованный капельный метод и возможности двухплатформенного секвенирования методом микропор обеспечивают анализ данных для международных научных исследователей. Услуги секвенирования развернуты в AliCloud. Однако, поскольку в аналитических процессах используются данные выражений, достигающие сотен тысяч чтений, анализ последовательности может дать сбой на традиционных экземплярах виртуальных машин из-за нехватки памяти. Кроме того, процесс экспорта и загрузки временных данных на диск во время задач секвенирования также может быть чрезвычайно длительным. Используя программное обеспечение MemVerge Memory Machine Cloud Edition (1), работающее на экземплярах виртуальных машин AliCloud i4p, которые оснащены энергонезависимой памятью Intel Optane (PMem), SeekGene теперь может использовать большие ресурсы памяти без изменения своего кода. Это позволяет SeekGene удвоить размер выборки и позволяет запускать в пять раз больше параллельных процессов. Кроме того, с MemVerge Memory Machine Cloud Edition компания SeekGene может повысить производительность загрузки и экспорта данных на два порядка, устранив узкие места ввода-вывода, вызванные чтением и записью диска. Конкретно:
«Используя MemVerge Memory Machine, мы можем использовать большие ресурсы памяти в облаке без рефакторинга нашего кода и устранять задержки, вызванные вводом-выводом хранилища, который в противном случае требовался бы в наших конвейерах», — сказал Синъонг Ма ( Xingyong Ma ), соучредитель и главный научный сотрудник. SeekGene. «В результате мы можем значительно сократить наше аналитическое время и затраты, оптимизируя наши возможности секвенирования отдельных клеток для исследователей во всем мире, чтобы способствовать более быстрому развитию точной медицины». «Сценарий SeekGene — типичный пример того, как исследователи в области биотехнологии могут революционизировать свой вычислительный анализ, используя технологию Big Memory в облаке», — сказал Джонатан Цзян ( Jonathan Jiang ), главный операционный директор MemVerge. «Эти рабочие нагрузки с интенсивным использованием данных теперь можно выполнять с рекордной скоростью и при значительно меньших затратах. Для биотехнологической отрасли это может стать настоящим прорывом». MemVerge Memory Machine позволяет приложениям использовать 100 % доступного объема памяти для нескольких типов памяти без необходимости рефакторинга кода, предоставляя при этом новые операционные возможности для рабочих нагрузок, ориентированных на память. MemVerge Memory Machine Cloud Edition распространяет эти преимущества на облачные рабочие нагрузки, предоставляя виртуализацию памяти, отказоустойчивость в памяти и услуги мобильности, которые организации могут легко добавить в свою облачную инфраструктуру. Приложения с отслеживанием состояния, отказоустойчивые и долго работающие приложения теперь могут реализовать обещание гибкости и гибкости облака. Более подробная информация о Memory Machine Cloud Edition доступна здесь. О MemVerge MemVerge является пионером в области вычислений с большой памятью для многооблачного мира. В современной облачной инфраструктуре существуют серьезные пробелы для высокопроизводительных приложений, интенсивно использующих данные. MemVerge® Memory Machine™ предоставляет программно-определяемую компонуемую память и интеллектуальную службу памяти для устранения этих пробелов. Являясь лидером программного обеспечения в экосистеме CXL, технология компонуемой памяти MemVerge выделяет, распределяет по уровням, дезагрегирует и объединяет разнородную память для масштабирования объема памяти и снижения стоимости памяти. Службы моментальных снимков в памяти MemVerge ZeroIOO обеспечивают прозрачную проверку, клонирование, репликацию и восстановление запущенных приложений в любое время и в любом месте в многооблачной вычислительной среде. В целом, технологии Big Memory Computing сокращают время до получения результатов и обеспечивают беспрецедентную доступность и мобильность приложений в памяти для ведущих предприятий. исследовательские институты и поставщики облачных услуг. MemVerge стремится демократизировать вычисления с интенсивным использованием данных для исследователей, ученых, аналитиков и инженеров по всему миру и освободить все рабочие нагрузки для перемещения в многооблачных средах повсюду. Чтобы узнать больше о MemVerge, посетите www.memverge.com . Memory Machine™ и Memory Machine ZeroIO™ являются товарными знаками, принадлежащими MemVerge. (1) Поддерживаемые приложения и инфраструктура Memory Machine™ Cloud Edition Supported In-Memory Applications
Supported Environments
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
